奥然生物创始人＆CEO余家昌先生、上海国际医学园区集团有限公司副总经理戴月明先生受浦东电视台邀约，做客创业故事汇栏目，谈论奥然生物的“创业江湖”。该栏目分别于2020年5月14日、5月16日在浦东电视台及东方财经浦东频道陆续播出。     01 奥然生物临危受命，科技抗疫     2020年1月26日晚，余家昌先生接到通知，奥然生物被上海市列为“生产能力紧急征用单位”，公司的即时分子诊断平台和新冠检测试剂将被征用于疫情防控。                 02 为何122cc太阳集成被列为征用单位               此次新冠病毒，传播快、传染性强，只有做到即时＊＊检测，切断传染源，才能有效控制疫情，并同时为感染者争取更多的治愈时间。而传统分子诊断对实验室要求高，满足核酸检测的实验室数量少，核酸检测的覆盖能力不足，导致核酸检测效率非常低；核酸检测时间过长，延误了感染者的及时确诊和救治，同时增加了检测人员的感染风险。         面对诸多传统分子检测的痛点问题，奥然生物颠覆传统分子检测模式，创新型的即时分子诊断平台和新冠检测试剂，更适用于在多种应用场景开展新冠核酸检测。在提高核酸检测即时性和便捷性的同时，杜绝内外源污染，进一步保障生物安全。             03 奥然生物即时分子诊断技术         样本进，结果出、 操作简便、 杜绝污染     预装试剂的智能盒，功能相当于“PCR三间房”，仅需将待测样本放入智能盒内，运用即时分子诊断平台（Galaxy系列全自动全密封荧光PCR一体机），智能盒在全封闭的空间内，全自动完成从核酸提取至荧光PCR检测分析的全流程，快速得到实验结果。         无需PCR三间房、人员要求低、节省实验成本、随到随检         04 实现研发到生产的完整工业化流程         奥然生物历经4年“痛苦”的研发历程，终于在2019年底实现从研发到生产的完整工业化流程。在此期间，奥然生物申请＊＊64项，43项获得授权，其中有8项发明＊＊，同时获得了8项软件著作权，其自主研发的产品Galaxy Nano全自动全密封荧光PCR一体机（POCT型号）、Galaxy Pro全自动全密封荧光PCR一体机（一次12样本高通量型号）、新型冠状病毒（2019-nCoV）核酸检测智能盒（荧光RT-PCR法）均获得欧盟CE认证，Universal Nano核酸扩增分析仪获得三类医疗器械注册证。     奥然生物获得阶段性的成功离不开整个团队的坚持和努力，同时也离不开政府和园区给予的大力支持，在此奥然生物深表感谢！         05 即时分子诊断一片蓝海，未来可期，仍在努力         即时分子诊断因其一体化，高集成度等特点，对研发企业技术要求高，目前仍处于蓝海市场。展望未来，奥然生物在余家昌先生的带领下，将一直探索核酸检测的更多可能性，进行分子诊断的应用和创新，为满足多元化行业需求，＊大化产品价值付出巨大努力。                

　　近日，中科院大连化学物理研究所研究员秦建华领导的研究团队在以微流控芯片为平台的模式生物秀丽隐杆线虫抗衰老研究方面取得新进展, 研究成果被选为封面文章发表在近期Integrative Biology (Integr. Biol., 2014, 6, 35-43)上。白藜芦醇苷是一种存在于天然植物中的功效成分，是白藜芦醇的糖苷衍生物，具有保护肝脏、抑制血小板聚集、抗菌、抗病毒、降血脂及抗脂质过氧化等多种药理作用，但对其抗衰老作用和分子机制等研究尚不清楚。该工作以经典的模式生物秀丽隐杆线虫为衰老模型，**建立了集单线虫进样、长期培养、运动监测、固定及成像多功能的集成化微流控药物评价平台，研究考察了天然提取物白藜芦醇苷对线虫的抗衰老作用及其机制。研究发现白藜芦醇苷可在正常和氧化应激条件下显著延长线虫寿命，改善其运动行为，并提高其氧化耐受能力。利用特定的转基因虫株，发现其延长寿命作用主要与胰岛素/胰岛素样生长因子-1信号通路的调节作用有关，它可以正向调节胰岛素信号通路中的DAF-16蛋白和下游抗氧化蛋白SOD-3的表达，而对此信号通路中衰老相关基因mRNA表达的研究结果也证实了这一结论。该工作发现了白藜芦醇苷对线虫的抗衰老作用及新的调控机制，显示了微流控芯片用于整体动物水平高通量/高内涵药物评价的潜力，并为抗衰老药物的研究和开发提供了一种新的平台。

据新华社华盛顿5月24日电，美国加州大学戴维斯分校的研究人员日前报告说，他们开发出一种可检测潜伏性结核病的微流控芯片，其优点是成本更低且更快速可靠。目前对潜伏性结核病检测主要基于伽马干扰素，后者是免疫系统细胞制造的一种抗病化学物质。目前市面上常用的检测方法要求将送检者的血液样品交给实验室，而且样品通常只能使用一次。研究人员将能与伽马干扰素结合的一小段单链DN**段涂在一片金晶片上，然后将这个晶片植入芯片中，后者含有为血液样本准备的微小通道。如果伽马干扰素存在于血样中，它就会与DNA结合，并触发一个可被医生读取的电信号。因此，如果芯片读出高浓度的伽马干扰素，送检者即可被确诊为潜伏性结核病患者。研究人员说，已就这一技术申请＊＊，并希望美国食品和药物管理局能批准这一新的检测技术投入使用。

新华网重庆８月２７日电（记者周凯）随着单独两孩政策在各地的落实，高龄产妇数量增加，及时进行孕前检查对于降低出生缺陷、提高人口质量至关重要。记者从第三军医大学西南医院了解到，国家批准第二代基因测序诊断产品注册后，部分医院已开展产前基因检测项目，可有效降低出生缺陷率。为避免唐氏综合征等染色体异常所导致的疾病患儿的出生，按照传统方法，孕妇需要在产前进行血清学筛查，若胎儿患病率高还要进行羊水穿刺。长期从事胎儿疾病诊断与宫内干预研究的第三军医大学西南医院妇产科主任梁志清教授介绍，这一传统筛查技术准确率相对较低，羊水穿刺又有流产的风险，而产前基因检测技术具有**、安全、无创、无需穿刺等优势，可提高出生缺陷筛查率，进而避免出生缺陷。此前，国内很多医院都开展了产前基因检测项目，但由于基因测序设备和技术未经审批，存在滥用、夸大效果等问题和伦理风险，今年２月相关部门“叫停”了所有的基因测序临床应用。７月２日，国家食品药品监督管理总局批准了华大基因第二代基因测序诊断产品注册，包括两款基因测序仪、两款检测试剂盒。西南医院妇产科产前诊断中心主任姚宏教授介绍，第三军医大学西南医院与华大基因合作，运用已取得资质的设备与试剂正式开展无创产前基因检测、孕前１２项单基因病等项目，可针对孕前期、孕早期、孕中期受检者，直接检测如地中海贫血症、白化病等单基因遗传性疾病。目前每天来做产前基因检测项目的产妇有２０多人，知道这一技术的产妇逐渐增多。姚宏教授表示，尽管产前基因检测技术的成熟度和可信度没有问题，但由于在我国临床运用时间不长，掌握这一技术的医护人员较少，此外这一检查项目费用偏高，在２０００元左右。“产前基因检测是防治出生缺陷的先进技术，随着覆盖面的扩大，检查费用会逐步降低，将会让更多的产妇受益。”姚宏说。

当“天河二号”以每秒33.86千万亿次浮点运算速度再次荣登全球超级计算机500强排行榜榜首的时候，我一直有两个疑问：一是33.86千万亿次计算能力是不是通过增加服务器数量就可以实现，有没有这么简单？第二什么应用需要如此强大并行计算能力，所谓计算能力是不是一个数字游戏。基因研究和超级计算机如今，这两个问题都有了答案。首先要实现千万亿次浮点运算不是那么简单的。以天河二号为例，参与LINPACK测试的节点有16000个，耗时5个多小时，在这个过程中，只要有一台服务器出现故障，测试就会宣告失败。这意味着如果节点服务器的故障率是万分之一，1.6万台节点服务器就意味着测试100%不会成功。因此，参与运算的机器数量越大，失败的风险越高。另外，节点之间的网络延时、效率都是问题。总之，要构建一台千万亿次超级计算机还是有很多技术难点要克服。

残疾人联合会和华大基因共同举办的遗传咨询沙龙现场，专家为受检者提供了遗传咨询和报告解读，并对其中部分患者进行家系验证，辅助疾病的诊断。此次活动是双方合作“预防出生缺陷—关爱，从了解开始”系列活动的一站，旨在面向有听力障碍和视力问题的儿童及家属普及科普知识，提高其对基因与健康的认知度。我国出生缺陷发生率高达5.6%，是导致儿童和成人残疾的主要原因。出生缺陷患儿会出现生长发育迟缓，智力发育迟缓，特殊面容，肢体以及内脏器官畸形等临床表现。给家庭和社会带来了严重的经济负担和精神负担。相关负责人介绍，他们希望通过现有的科学技术，帮助这些有遗传性疾病的患者和家庭尽一份微薄之力。活动为部分患者免费提供听力和眼科的基因检测，希望通过基因检测及数据解读发现致病基因。不仅可以辅助疾病的诊断，也可了解自身致病基因携带情况，及早干预。同时，活动还为有生育需求的遗传病患者及遗传病家族史成员，提供遗传咨询及健康生育指导，从而更加有效地防止或减少婴儿出生缺陷的发生。

深圳国家基因库研究团队成功研发出一套基于第二代高通量测序技术，用于混合样本的线粒体基因组测序方法。该方法具有低成本、高通量的特点，极大的提高了大规模获取动物线粒体基因组的效率,该研究成果于2014年10月7日在线发表于《Nucleic Acids Research》杂志。这套流程为国家基因库万种线粒体基因组计划（MT10K）奠定了技术基础。 后生动物的线粒体具有进化快、丰度高，遗传模式简单等优点，线粒体基因组也都具有保守紧凑的结构特点，因此很多线粒体基因——尤其是细胞色素C氧化酶I亚基COI基因片段作为条形码被广泛用于物种的分类和鉴定。近年来，DNA宏条形码技术（DNA metabarcoding）发展迅猛，被广泛应用于生物多样性研究，大大缩短了生态学研究周期，显著提高了生物多样性调查效率，而线粒体数据库的全面建立将极大地促进生物多样性研究的发展，全面开启线粒体宏基因组（mito-metagenomics）生物多样性研究的时代，为生态学研究提供更全面地第一手资料。 线粒体全基因组在生物进化的研究中也具有独特的优势。由于线粒体有着与真核生物长期共生的进化历史，因此其基因组包含了反映物种进化的关键信息，同时，相对于核基因组，线粒体基因组小，容易对大量物种进行横向的比较分析，有利于生物进化的研究，因而受到进化生物学家的钟爱。线粒体的组成可以从两个层面上反映物种及群体的遗传和进化，即核酸序列和基因组的结构特征，两者的特征具有不同的进化机制和进化速度，在进化生物学研究中可以很好的互补。另外，线粒体是真核生物的重要细胞器，是生物体的能量工厂，对生物的生理活动起着至关重要的作用，因此也是细胞核与线粒体协同进化的重要分子标记。全面而完善的线粒体全基因组数据库能够为系统发育、进化及其生理功能研究提供重要的支持。 传统线粒体全基因组的获取依赖于PCR和叠瓦式测序，成本高、效率低，随着测序技术的发展，序列获取效率大大的提高了，但文库制备成本一直居高不下，难以推进大量物种线粒体基因组测序，而已有混合测序的尝试也仅局限于少数几个物种。国家基因库的研究团队在周欣博士的带领下经过两年的技术研发，**成功混合测序并组装获得49个物种的线粒体基因组。新方法将49个物种DNA混合，无需PCR，仅制备一个文库进行测序，节省了大量建库成本；先进整合的信息分析流程成功产出49个线粒体基因组并一一归类到每个物种，其中36个长达15 kb以上，包括20个完整线粒体基因组，剩余13个都长于10 kb；百余条序列利用Sanger序列法严格验证了新方法所得序列的可靠性。 在已发表的文章中，研究团队的论证表明利用新的方法，DNA质量好坏对线粒体基因组获得影响不大，即使降解严重如博物馆陈旧标本的样品也有可能适用于该方法，这是十分振奋人心的消息。另外，在49个物种中，3种果蝇也成功获得线粒体基因组，表明该方法对混合物种的选择限制较低，可以用于近缘物种的混合测序。研究团队指出，新方法可以极大地降低获取单个线粒体的成本，同样的测序量或可以用于更多的混合物种，从而进一步降低获取海量数据的代价，为全面构建线粒体基因组数据库提供了新的途径。随着MT10K项目的开展，国家基因库将与国内外学者合作谱写线粒体基因组百科全书。

2014年9月22日，深圳－在非洲亚撒哈拉地区及东南亚地区，真菌培养白蚁在生态系统中扮演了非常重要角色，是植物残体的主要降解者。在某些地区甚至高达90％的植物残体由这种白蚁分解。真菌培植白蚁在其肠道微生物及其所培植的真菌（Termitomyces属）的多步协作下，可以几乎完全分解植物纤维素。于此，真菌培植白蚁与其肠道微生物及所培养的真菌形成复杂的共生系统。来自哥本哈根大学社会进化研究中心以及华大基因的研究人员对一种真菌培植白蚁、其培植的真菌以及白蚁的肠道微生物进行了基因组测序，揭示了这一复杂的共生系统，并对植物纤维素分解相关的基因进行了深入分析。这项研究于今天在PNAS杂志上在线发表。这些白蚁通过一种高度结构化的分工协作方式来管理它们的真菌种植园。年龄较大的工蚁负责采集植物材料并将其运回巢穴。年龄较小的工蚁将植物混着真菌的孢子一起食用，然后把消化后剩下的植物和孢子的混合物排泄到真菌种植园中。种植园中的真菌利用这些白蚁提供的植物底物迅速生长，当其生长到一定程度后被年龄较大的白蚁食用。至此，所采集植物中的有机物质几乎都完全被降解。通过研究发现，所有已知的糖类水解酶中有86%都能在这种白蚁－真菌的共生关系中找到。其中，真菌的基因组编码了一些负责分解复杂碳水化合物的基因，而肠道微生物主要提供了*终寡糖降解相关的酶。因此，白蚁第一次消化时主要是将真菌孢子接种在植物底物上，而肠道菌群则在第二次消化时扮演了主要的分解任务。白蚁的巢穴由一对白蚁王白蚁后飞离原来的巢穴后建立。建巢之后蚁王蚁后会蜕去翅膀并终身居住在地下的“＊＊”里。随着蚁群的逐步扩大，蚁后会变成一个体型巨大的产卵机器。白蚁蚁王蚁后通常可以生存几十年，它们管理着寿命较短的工蚁和兵蚁来维持庞大蚁群所需的各种职能。这项研究中的宏基因组分析表明，白蚁蚁后肠道相比于工蚁含有高度简化的菌群，而且缺少降解植物的所需的酶。这说明白蚁蚁王蚁后不需要承担降解植物的工作，而是由工蚁喂养真菌来存活。来自华大基因研究院的共同第一作者胡皓夫表示：“由于和真菌的共生关系，真菌培植白蚁是一类非常独特的物种。通过对白蚁基因组、肠道菌群和它们的共生真菌的测序和分析，我们可以对这种白蚁在肠道细菌和真菌的帮助下降解植物的独特方式有了更多的了解。” 本世纪以来工业界投入了大量的资金用于研究如何利用纤维素来生产可分解的糖类作为绿色能源。但设计一个逐步分解纤维素的生产过程一直以来仍是一个巨大挑战。这一过程需要多种不同微生物相互协作分解原始的有机物并产生能源，并产生极少的废料。与人类社会的运转相似，形成系统的分工协作是完成这一复杂工程的关键。通过自然选择，这个难题在真菌培植白蚁身上被解决了。在这个由白蚁操作的生物反应器中，真菌参与有机物降解的粗加工，白蚁的肠道微生物作为补充从而完成了**的降解工作。不仅如此，它们在这一过程中程度的降低了废料的产生。值得一提的是产于我国云南的美味可口的鸡枞菌就是这类白蚁培育的真菌的子实体。

由美国Salk研究所、深圳华大基因研究院和中科院生物物理研究所等中外科学家组成的研究团队近日宣布，他们通过利用全基因组测序(WGS)明确了现有疾病基因组靶向矫正工具的安全可靠性，并突破性的创建了新型人类遗传突变修复工具telHDAdV，为今后以干细胞为基础的基因治疗提供了重要的理论依据。相关的研究成果发表于2014年7月3日的《Cell Stem Cell》杂志上。人诱导多能干细胞技术(iPSC)是近来科研界的一大热点。所谓iPSC技术，就是利用病毒载体将转录因子转入分化的体细胞中，诱导细胞重新编程从而获得类似于胚胎干细胞的自体干细胞的技术。这一成就荣获了2012年的诺贝尔生理学奖。目前，iPS干细胞在体外已成功地被分化为神经元细胞、神经胶质细胞、心血管细胞和原始生殖细胞等，在神经系统疾病、心血管疾病等临床疾病治疗中具有巨大的应用介值。而且iPS干细胞不需要使用卵细胞或者胚胎，这在技术上和伦理上都更有优势。在本项研究中，研究人员**综合利用HDAdV，TALEN和CRISPR三种不同的方法，对镰刀形细胞贫血症患者iPSC中发生突变的血红蛋白基因(HBB)进行靶向矫正。研究结果表明这三种基因矫正方法对于HBB基因具有类似的打靶效率。此外，研究人员还通过全基因组深度测序发现TALEN和HDAdV在基因矫正过程中能**限度地保持了病人基因组的完整性，因而是十分安全可靠的。之后，研究人员通过整合TALEN和HDAdV，创建出一种新型的疾病基因矫正载体telHDAdV。telHDAdV同时具有TALEN的特异性基因组切割和HDAdV的高导入效率及精确的大片段同源重组效率。在一个telHDAdV上，可以有效涵盖HBB基因座上所有可能包含的遗传突变，因此，telHDAdV可作为一个有效工具来治疗包括镰刀形细胞贫血症和地中海贫血症在内的不同种类的血红蛋白疾病。＊后的实验结果表明，telHDAdV介导的基因修复比单独使用TALEN和CPRISPR在效率上约高数十倍。研究人员表示，telHDAdV，作为一个新型遗传突变修复工具，可在将来被应用于不同种类的人类致病基因突变的靶向矫正。